这个决定自然是令教廷大为光火。教廷为此派出了一名特使前往奥地利，要求弗朗茨二世皇帝立刻取消这个决议。但是这名特使却在维也纳遭到了不明身份的人的袭击，并因此受伤，不得不临时中止使命返回教廷。
这一事件让弗朗茨皇帝有些被动，但是他依旧坚持，在教廷取消对他的“侮辱性的调查”之前，他不会允许一个金币离开奥地利流向梵蒂冈。
于是到了这一年的九月份，教廷再次向弗朗茨发出照会，要求奥地利限期上缴十一税，否则就将对弗朗茨二世皇帝采取“断然措施”。
但弗朗茨二世皇帝继续不为所动。而奥地利的媒体也开始对教皇发起直接的攻击，甚至扬言说奥地利应该像亨利四世皇帝当年那样，打到罗马去，帮教廷换一个教皇。
当然，这种狂言，也只是说说而已，因为如今，奥地利和教皇国之间还隔着法国人的核心盟国——北意大利共和国呢。
另一些报纸则对教皇进行了各种嘲讽。他们嘲笑教皇根本就是在虚张声势，根本就不敢怎么样，一家报纸甚至在漫画中将教皇冕下描绘为躲在耶稣圣像后面瑟瑟发抖的胆小鬼。
有意思的是，弗朗茨陛下的反抗反而让他在民间的形象好转了不少。自从在和法国的战争中不断地蒙受失败之后，弗朗茨二世陛下就被很多人认为是患得患失，懦弱无能的代表，甚至于在编排他有不道德的倾向的时候，也将他描绘为“万受无疆”的那个。如今的一番操作之后，大家到还觉得皇帝陛下还有点男子汉的味道，像是一个皇帝了。
当然，这样的做法自然也让教皇不得不真正的做出反应了。于是，在1804年2月，教皇冕下正式下达敕令，宣布革除弗朗茨二世的教籍，并剥夺其“罗马人的皇帝”的称号。
而对于教廷的举动，奥地利也立刻加以回应，他们宣布教皇庇护六世年老体衰，神志昏迷，已经不适合再担任教皇。因而奥地利不承认庇护六世教皇发出的敕令的有效性。而弗朗茨二世皇帝陛下自然依旧是天主教徒，以及“罗马人的皇帝”。
而对于教廷和友邦奥地利之间的矛盾，法国人摆出了一幅和我没关系，我就是看戏的的样子。在官方层面上，法国外长塔列朗发表了这么一个声明，他在申明中表示：
法兰西共和国一贯坚持宗教自由政策，一贯坚持不干涉他国内政的原则。法兰西共和国希望看到世界上各个国家，各个宗教之间都能够和平相处，求同存异，共同进步……
总之，塔列朗外长虽然说了很多的话，但是真正压缩一下，基本上就是这么一句：关我屁事？
甚至于法国的媒体也没太在乎这件事情，这个时间虽然在第一天的时候，成功地登上了《科学真理报》的头版，但是却没能占据头条位置，因为头条位置的新闻是：“法兰西科学院正式颁发‘普罗米修斯奖’”。
是的，教皇宣布开除弗朗茨二世教籍的日子，正好就是法兰西科学院颁发第一届“普罗米修斯数学奖”和“普罗米修斯医学奖”的时间凑到一起了。所以这个决定不仅仅是没能在《科学真理报》上登上头条，也几乎没有在其他主流的报纸上登上头条。