瓜州城位于长江以北运河以东，是一座周长一千五百四十三丈九尺，高二丈一尺的小城。因为瓜州渡口非常之重要，城内设有同知署、工部分司署、管河通判署等衙门，便是两淮盐运司也在瓜州设立了批验所，用来核查盐引。
长江宽阔浩瀚，运河相对狭窄，很多原来的船只到达瓜州后会停泊数日，或修整或等待进入运河。渡口的繁忙催生瓜州的繁华，运河两岸店铺林立，很多商贾甚至在瓜州买地置宅。瓜州城内大型建筑、私宅花园、庵庙、楼、亭、厅、堂等多达数十处。
禁卫军入城控制了城防，朱由检也在禁卫军保护下进了城中，暂时驻陛在一处私人园林之中。此园林主人是一个大盐商，在扬州被抓，现在还关在扬州大牢中。
皇帝停在了瓜州，让很多人感到意外，直到三日后，一支庞大的船队从长江下游驶来瓜州，很多人心中的疑问才得到了解答。
说是庞大的船队，其实数量并不多，也就五十余艘船舶，但问题是这些船舶太过庞大，竟然都是海船，特别是其中最大的五艘，那真是高大如楼，其停在江中，甲板看起来比瓜州城墙还要高！
再看着船队桅杆上飘扬的旗帜，“福建总兵”、“伏波将军”、“李”，很多人顿时明白了过来，明白了皇帝为何停留在瓜州。
“是福建总兵李彦直，听说他是皇帝禁卫军出身，负责为皇帝镇守福建！”有人惊道。
“怪不得皇帝停留在瓜州，原来是等着福建水师过来会合啊，福建水师先后击败数股海盗，把东南海商压得喘不过气，现在被调到瓜州，难道皇帝要有大动作不成？”有人狐疑道。
“什么大动作啊？”
“说不好，这种情况下，还是赶紧离开吧。”
一时间，福建水师的到来让瓜州渡的商贾们震惊万分，长江中运河中无数的商船纷纷拔锚起航，或者通过运河赶往北方，或者干脆如鸟兽散，纷纷原路返回避往他处。小半天的功夫，瓜州渡周围的船只竟然为之一空，只留下停泊在瓜州的皇帝船队和江中的水师战船，看起来颇有些风雨欲来风满楼之势！
对瓜州福建商船的举动李彦直自然不在意，早在半月前，他便收到了皇帝密旨，命他带领福建水师进入长江。安排好福建的事务之后，李彦直立刻召集麾下禁卫军、率领船队北上，通过舟山群岛、绕过杭州湾，进入了长江来到瓜州。
李彦直安顿好属下船只在江中驻扎，带着李定国、张煌言等将乘坐小船登上了瓜州码头。
“终于能见到陛下了！”踏上岸上的土地，李定国喜笑颜开道。受命前往福建已经一年多时间，李定国对朱由检十分想念。
张煌言没有说话，但脸上的神色一样的欣喜。