1月3日，潘妮·切纳里的父亲马主Christopherery病逝。
为了应对美国高昂的遗产税，潘妮·切纳里女士和家族的其他遗产执行人决定以团体马匹名义出售此驹的拥有权，一份达19万美元，共32份。
这在当时，已然属于天价，正常的家庭根本拿不出这笔钱，而曾经与潘妮·切纳里掷硬币的对手，美国首富奥格登·菲普斯，显然被秘书处的成绩征服，买下了其中一份拥有权。
到了这时，秘书处便开始准备争夺美国三冠王，这是任何赛马要奠定自己历史地位，都要取得的荣誉。
不过在赛前，秘书处却因为得了口炎，受了口腔脓肿的影响，秘书处在角逐前哨战WoodMemorial伍德纪念锦标赛，出人意料的被同马房的AngleLight以四个马位胜出，秘书处只获得一个季军。
这个时候，一些马评师们对秘书处能否赢得肯塔基德比表现出了怀疑，因为在西海岸活跃的赛马Sham，正轻松赢得圣雅尼塔德比，并且正是在伍德纪念锦标赛上Sham获得第二，战胜了秘书处。
当然，神一样的马，显然不会因此就走向低迷。
肯塔基打吡赛当日，秘书处为大热门，次热门是Sham。
比赛开始，内栏带头的是Sham，至于在较外位置的秘书处也在正追上，在250米处“秘书长”发力绝尘而去，结果大胜八个马位，并以1:59.4赢出肯塔基打吡，至今为止这个成绩仍然没有马能够打破。
两星期后的第二场必利是锦标，只有六匹马上阵。
秘书处起步较慢，在第五、六位，在转第一个弯位后及时加速。将Sham、EcoleEtage追过，并取得领先。
最后只剩下Sham追上，其他马均被甩开，虽然一度被追近，但是最后还是保持两个马位优势领先。
至此，秘书处赢出三冠第二关，记录时间为1:53.40，但在2012年6月经讨论以及翻查赛事的录像带后，确定“秘书处”以1:52.0时间完成，也成为必利是锦标最快的时间。
第三战，又是在两星期后的贝蒙锦标，并且也只有五匹马上阵，除了秘书处外，在肯塔基打吡及必利是锦标跑获亚军的Sham仍然上阵，其他马匹却是机会平平。
起步后，秘书处与Sham两马斗法，互有领先，但秘书处放跑的速度非常快，跑到中后段时，Sham已经跟不上，结果跑包尾而回。
最后就变成了“秘书处”的表演赛，结果以传奇性的31个马位大胜而回，时间是2分24秒正，是一个相当吓人的时间。
到现在为止，都还没有马在此路程做出靠近的时间，其它马留下的最快的都是2:26秒。
至此，三冠王到手，美国震惊！
因为已经很多年没有马，得到三冠王了。
三冠过后，首先在雅灵顿角逐雅灵顿邀请赛，轻松以九个马位大胜。
接下来角逐二级赛韦特尼锦标，不过却吃了一记败仗，在赛事中一直受到Onion压制，没有机会超越对手，结果跑获第二。
再之后是贝蒙园当时首办的赛事万宝路杯邀请赛。
秘书处最大的对手是同马房的1972年肯塔基打吡冠军RivaRidge，结果“秘书处”轻松把RivaRidge追过，以1:45.4打破纪录时间赢出，RivaRidge跑第二。
然后角逐活华锦标，当时是哩半的一级赛，秘书处应该在平磅赛中有一点把握，可是被四岁马ProveOut反压，被对手取得领先，结果由ProveOut赢出，当时“秘书处”离开泥地转跑草地，间接避开了赛马会金杯的硬仗。
转跑草地，改为角逐斗士锦标，在赛前一次草地快跳，以56.8s完成1000米赛事，骑师RonTurcotte在赛后表示，当Tentam迫近时，就轻轻推骑把其拉离。
以五个马位大胜。接下来继续挑战草地赛，就是加拿大国际锦标，在这场2600米赛事中，秘书处也轻松地以6个半马位大胜。
赛后按计划退役，在配种前于雅佳特马场作最后一次公众露面，至此，秘书处在日蚀奖中，夺得美国马王、最佳三岁雄马以及最后草地雄驹三个奖项，成就惊人！