袁崇焕一面坚壁清野，一面让同知程维楧盘查奸细，通判金启倧守护粮草，并传檄给前屯守将赵率教、山海守将杨麒，如果宁远城守军有人逃到他们那里，可全部斩杀！
努尔哈赤劝降无果后立刻率军大举进攻宁远城，并让士兵举着盾牌攻凿城墙，而袁崇焕让罗立等人指挥西洋巨炮，炮轰后金军，后金军在巨炮的攻击下溃不成军，连续攻城两天，损失惨重，努尔哈赤不得不下令退兵。
传闻，在此战中，努尔哈赤因坐骑中炮，跌落马下，留下了暗疾，回去之后，不到几个月时间便不治身亡了。
袁崇焕率不到两万守军创造了一个奇迹，他们竟然将六万后金精锐和十余万蒙汉协从军组成的联军给击退了，还歼敌数千人，这是大明与建奴开战以来首次取得如此惊人的大胜，消息传回京城，满朝上下无不欢欣鼓舞，建奴几乎不败的神话终于打破了，他们仿佛看到了收复辽东的希望。
魏忠贤这会儿想的却不是怎么收复辽东，而是怎么把自己的亲族提拔起来，光宗耀祖！
宁远大捷，来的正是时候，他将所有亲族全部写进了辽东军将领名单，就连只有一两岁，还在喝奶的婴儿都被他写成了领兵将领！
这一战，魏忠贤并没有出力，他甚至让高第下令辽东所有军民撤回关内，省得麻烦，袁崇焕抗命不尊，不肯率军民撤回关内，正是违抗了他的命令，但是，袁崇焕取得大捷之后，所有功劳却成了他提拔亲族的工具！
他的亲族几乎全部因宁远大捷的军功加封正一品的五军都督府都督，他的族侄魏良卿进封肃宁侯，他的族侄魏良栋进封东安侯，他的族孙魏鹏翼等全部因军功进封伯爵！
而真正率军取得大胜的袁崇焕却只是进了一个小品阶，他原本就是从五品的宁前兵备佥事，立此大功却只是加了个五品的都察院右佥都御史！
如此滥用国器，抢夺军功，大封亲族，直接令辽东将士心寒不已，袁崇焕更是气得差点没喷出血来！
天启七年五月，皇太极率十余万大军再次来袭，他率兵直抵锦州，将其包围。
锦州守将赵率教与纪用一方面闭城坚守，一方面派人向宁远求援，袁崇焕手中本来就没有多少兵力他还是让让尤世禄和祖大寿率领精锐骑兵四千绕到建奴大军后面骚扰，又派出水军从东面进行牵制，并请求蓟镇等地发兵东护山海关。
皇太极久攻锦州不下，又分兵来攻宁远，袁崇焕与刘应坤、毕自肃率将士登上城楼防守，在濠沟内排列阵营，用炮远距离轰击。而满桂、尤世禄、祖大寿也率军在城外与建奴激战，双方死亡都相当惨重，连大将满桂都中箭负伤，袁崇焕更是浑身浴血，死战不退。
皇太极见宁远不可下，只得从宁远撤兵去加强锦州的攻势，但是，仍旧无法攻克锦州，他率军进攻了将近一个月，不但一座城池都没拿下来，还伤亡惨重，无奈之下，他只有率军撤退，袁崇焕再次率军击败建奴，取得大捷。
宁锦大捷后，魏忠贤再次抢夺军功，他自己连辽东都没去过，却因军功进封一等公爵，他的侄子魏良卿连辽东在哪里都不知道，也因军功进封太师、肃宁公，他的侄孙魏鹏翼还是个婴儿，也因军功进封太子太保、安平侯，而袁崇焕却因不听他的命令，被他指使党羽弹劾！
这次，真把袁崇焕给气坏了，他直接提出辞呈，不干了。
魏忠贤把人军功都夺完了，自己的亲族也全部封侯进爵了，这袁崇焕好像也没什么用处了，所以，他毫不犹豫的批了，直接让袁崇焕滚蛋！
就这样，接连取得两次大捷的袁崇焕什么好处没捞到，还被人弹劾的怨气冲天，愤而辞职，回家种地去了！