临走时李大同意了韩复举的“种子计划”，并让他全权负责此事，需要什么直接找赵俊彦。
之所以让他负责，主要是这项计划太敏感，不好对外人明言，交给其他人负责，容易让执行者会错意，到那时效果肯定会打折扣，倒不如直接让韩复举来，再说这项计划并不涉及军政、民政、财政，交给他李大还是比较放心的。
十日后，大员宣抚使司下属的幕府正式成立了，这个幕府就是军政大吏的府署，其主要功能为：置备顾问、咨议谋划、参与决策、掌握机要、典属文书，乃至迎接宾客、经办庶务或代主巡行出使等，其中尤以参议决策和掌握机要为重。
大员宣抚使司幕府下辖：
招募司，负责招募流民；
屯垦司，负责屯田；
后勤司，这个部门类似于后勤大总管的角色；
建造司，负责道路、桥梁、房屋、工坊的建设；
教化司，前身是赵俊彦的教育司，现负责大员的整个教化工作；
规划司，现今规划司的重心已然放在了婆罗洲那里；
财政司，自然就是负责整个大员的财政喽，可以毫不夸张的说，财政司乃幕府第一司；
巡防司，负责大员的治安工作，仍是集公检法司权力于一身；
纠察司，前身为情报司，只不过情报二字太惹眼，所以改为纠察司；
吏幕司，这个部门是新组建的，职能相当于朝廷的吏部，负责吏员的升迁任免；
商务司，这个部门也是新成立的，职能是主官大员的整个商事，八闽商行也被纳入其中，因为体量的原因，商务司设有5位主事，分别为李二、王立诚、赵大宝、何老三、谢庆，其中李二为大主事，总管商务司中的一切事物。
各司主事都是沿用之前的人选，说白了，就是之前飞鱼帮的那套班子换了一个名称而已，所有部门名正言顺地走到台前。
幕府的设立并未引起任何波澜，一切照旧。
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