宋朝灭亡后，元朝也继承了宋朝武庙的祭祀，并且两次加封关羽，并且多次减少武庙中的名将，但武庙的主祭祀仍然是姜子牙。
到了明朝后，明初朱元璋把姜子牙入侍历代帝王庙，并废除了武庙，所以明初武庙就不存在了，其中供奉的名将也就不再祭祀了。
到了明朝万历年间，重建了武庙，明神宗万历皇帝不仅加封关羽为“三界伏魔大帝神威远镇天尊关圣帝君”，而且把关羽定为武庙的主祭。
而陪祀是周仓和关平。
这是因为关羽的封号是“关圣帝君”，又是明朝武庙的主祭祀，所以关羽在明朝开始，取代了姜子牙成为新的武圣。
所以，关羽成为武圣是在明朝开始的，之后的明朝末代皇帝明思宗崇祯皇帝加封关羽为“真元显应昭明翼汉天尊”，并且从明朝开始，关羽的武庙主神地位与孔子的文庙主神地位开始并祀，明朝末年的对于关羽的祭祀达到了一个顶峰，在当时的北平城内外就有关帝庙近百所。
进入清朝后，关羽的祭祀再一次达到顶峰。
雍正八年，清世宗雍正皇帝正式追封关羽为武圣，并建立了以关羽为主祀的武庙的祭祀系统，也就是关帝庙，并与孔子的文庙并列，合称文武庙，在整个清朝，关羽的地位那是相当高的，并且取代了姜子牙成为新一任的武圣。
在清朝近三百年的历史中，十次加封关羽，最后一次加封是在光绪皇帝。
光绪皇帝加封关羽为“忠义神武灵佑仁勇威显护国保民精诚绥靖翊赞宣德关圣大帝”。
名字越来越长，谥号越来越多，都是为了配合武庙祭祀而加封的，所以至今关羽也是武庙主祭，更是武圣。
关羽的确是武圣，那么有问题来了，岳飞呢
岳飞文武双全，不仅个人武力突出，而且练兵、带兵打仗都是一流，至少在南宋初年没有人比得上他。
岳飞因为是在宋高宗赵构的主持下叛定罪名成立被杀的，但很多人知道他是冤枉的，一直到他被杀的二十年后，才由宋孝宗下诏平反，并且给了岳飞谥号为“武穆、忠武”，并加封号为鄂王，但岳飞没有进南宋的武庙。
到了南宋宋理宗时期，把南宋都城临安府太学中的土地庙改称为“忠显庙”，以纪念岳飞。
同时把岳飞被封为庙神“忠文王”，这是对岳飞的一种祭祀，但并非武庙中的祭祀，与武庙也毫不相干。
宋朝灭亡后，元朝改组了武庙，只保留了十哲，其他全部删除，所以元朝的武庙中也没有岳飞。
但在元顺帝时期，将岳飞封号在宋代封号的基础上增加了“保义”二字。
到了明朝，由于朱元璋废除了武庙，所以武庙不存在了，而岳飞则从祀于历代帝王庙，配宋太祖享，谥号仍然是忠武。
到了明神宗万历皇帝时期，岳飞被封为“三界靖魔大帝”，而当时的关羽也被封为“三界伏魔大帝”，此时岳飞的封号虽然与关羽类似，但是关羽可是进入武庙成为主祭祀，但岳飞并没有进武庙。
而是在民间有不少岳飞庙，也叫”宋岳忠武王庙“或者”忠武庙“，最有名的一座是在河南ay市汤阴县，据说修建于明朝景泰元年，这可比明神宗加封岳飞早了一百多年。
所以在明朝时期，岳飞并未进入武庙，更多是民间祭祀，到了清朝时期，武庙的主祭祀仍然是关羽，没有岳飞，只是民间有一些把岳飞和关羽并列的庙，称为关岳庙，但数量较少，也并非主流祭祀。
到了后来，有人再次重建武庙，把关羽和岳飞一起放进武庙，到了这个时候，岳飞才真正进入武庙，也是唯一一次进入武庙。
这时的武庙被称为关岳庙。
但是很快这个人倒台了，这事就没了下文，又因为这人本就不为人承认，所以岳飞这个武庙进得很尴尬，也不被人承认。
所以准确地说，岳飞从来也没有进入过武庙，华夏历史上武庙的主祭祀只有两个人，就是姜子牙和关羽。
“关羽竟然是武圣，岳飞不是，这是凭什么”