最后剩下的便是护军和匠作局了，这都是管辖人员最多的两个单位，当然也是今天人事安排的重头戏，所以大家的注意力还是放在了这里，一大帮还没有得到任命的人都眼巴巴的看着殿下手中的那张写满字的纸
谜底很快揭晓，整个护军编制除做出舟、步军比例调整外，其它内容与原方案没做大的改动。下辖两部，三营舟军和两营步军，共领官兵二千六百八十一名。设统领一员，副统领两员，拨发官一员，训练官十五员，部将、队将三十人，步军教头十七人，水军教头二十人。护军统领由赵孟锦担任，统领之下设两位副将，分别落在了刘洙和黄显耀身上，他们同时又兼领舟军和步军。
赵昺之所以选择赵孟锦为护军之首，不排除其出身宗室的原因，如此起码忠心是可以保证的，当然这也只是一方面。最主要的是他发现赵孟锦貌似粗鲁，行为鲁莽，但其行止坐卧一直保持着军人的姿态，且其管理的东院秩序井然，一切皆如军中，也未曾发生过鸡鸣狗盗之事，显然其有整军之才。而当今王府中的将领水陆实战经验丰富，又长期领兵的也只有赵孟锦。
刘洙此前任晋江东石寨兵马统领，东石寨是水寨，驻有战船五艘、水军五百，专门抵御水寇海盗，维持地方治安，平定。他们虽属地方军，但南宋后期战争常年不断，正规军消耗严重，战斗力日渐衰弱，每当战事紧急，地方军也常常被征调御敌，因此他并不缺乏实战指挥经验，而手下兵勇也训练有素。
黄显耀虽然没有官身，年纪也轻，但他出身将门，随父亲常驻军中，协助其管理军队，因此熟知军旅。而在勤王途中，在作为泉州州将的父亲殉难后，作为少将军的他迅速接过指挥权，保证队伍没有溃散。接着代父指挥作战，保护皇帝杀出重围，其能力可见一斑，也因而得到了众军的拥戴。但其管理的西院因为以乡勇为主，也导致营区混乱，让赵昺很不满意，可瑕不掩疵，还是决定让他担任步军统领。
匠作局的主事由周翔接任，这个人在赵昺看来毛病最多，不仅胆小怕事，而且有点贪小便宜，还是个官迷。但也不是没有优点，起码其在军器监中混了多年，对各种武器的制作流程十分熟悉，这个赵昺是暗中考察过的，更重要的是他手里掌握着一群熟练的工匠，可以通过他招来一批现成的可用之人，现在赏他个官做，赵昺相信他肯定会更加卖力的。
府中各单位主事全部任命完毕，各部下级军官的选任权赵昺就交给了他们，而自己没有参与。他这样做一者对下边的人实在是不熟悉；二者将权力下放，有助于提高新任主官的威信；三者他们即便是为了维护自己的利益，也不会选拔庸才，而任用亲信也有助于队伍的相对稳定。但赵昺要求各部选拔前一定要将府中的规矩传达到每一个人，要走的人可以到总计局领取盘缠。
为公平考虑，赵昺采用自上而下的选拔方式，即由舟、步和匠作三位统制先各自选出所属正、副将及训练官等职司；再由选出的人挑选所属队将、旗头、教头等基层军官；最后再由这些人从义勇中选兵。但其中有两人有特权，一个是亲卫营的倪亮，另一个却是匠作局的周翔，他们可以先行选拔，就是两人都相中一个人，他们可以带走。
对于倪亮有优先权，大家没有话说，毕竟亲卫营是直接保护王爷的，必须要用忠诚可靠，武艺高强之人。而对周翔就颇有微词了，因为说起来他就是个工匠头儿，可在大宋工匠的社会地位是不高的，在军中也处于辅助地位，平日没有人拿他们当回事儿的。但赵昺却知道战争史可以说正是由工匠们推动的，正是他们发明了各式各样的先进武器，从而使战争变得更加残酷、血腥和高效，可以说一个好工匠就能在一定程度上改变历史，若不是自己是个王爷，他都想亲领匠作局，自己干这个肯定比当王爷称职。