因此在从赤井秀一这里，知道基尔其实是cia的卧底后，柯南很快就想到了，再让基尔回到组织的计划。
柯南对赤井秀一说出自己的计划后，赤井秀一沉默了秒。他看出这个boy就是为了打击组织，而没有想到其他的什么，但这个计划确实是fbi能利益最大化的方案。
本来，他们抓到了基尔，这是很好的成绩，奈何基尔并不是组织成员，而是cia的卧底当然，这个结果也不算差，毕竟fbi和cia是冤家，又是本国特工，抓住cia总比抓住其他机构的特工要好。
再把基尔送回去吗
以本堂瑛祐为筹码，让本堂瑛祐加入fbi的证人保护计划
对着醒过来的本堂瑛海提出这个方案时，赤井秀一认为他确实在基尔眼中看到了无奈。本来，基尔完全可以借着这个机会“撤离”，或许cia会不满，但这已经属于卧底失败了，重新回到本部可以做其他工作。可现在，她确实只有这个选择了。
柯南或许认为证人保护计划是一个很不错的选择，但知道更深层次两个机构交锋现状的赤井秀一，如柯南所想说出这个交换要求时，基尔却很自然地将这个当做是威胁和交换条件。
她陷入沉默。
柯南看看她，又看看赤井秀一，不明白为什么两个大人的神态都这么严肃。这难道不是双赢吗
赤井秀一也觉得这个选择有些过分，可这对他，和对fbi来说都是利益最大化。如果基尔完全失去了卧底的心气，那么他会在谈话时放弃这个方案，但他看得出来，基尔对组织还有恨，她只是在犹豫。
而这对她本人也是有利的如果就这样卧底失败，她回到cia也会受到问责，但如果她能继续回到组织卧底，那么她持续输出情报的话，cia那边也能交代。
她最后同意了这个方案，要求fbi好好保护自己的弟弟。赤井秀一听她的语气，看她的神色，就知道她认为fbi这是抓住了人质。他没有解释。证人保护计划必定要经由fbi总部，但赤井秀一决定在申请时不将本堂瑛海和基尔的身份写入资料中，而是以另外的重要证人的身份。
他并没有打算将本堂瑛祐当做人质。
但没必要现在就和基尔说，说了基尔也不会信。让基尔以为自己被威胁，她才会更多情报。至于憎恨和厌恶赤井秀一并不在意。
他自认不算是完全的好人，也就不在意被别人当做坏人。
计划定得很急，因为柯南通过邮件声音发现医院里有组织成员存在后，才刚得到证明进行追踪时，那位组织成员就直接自杀了。赤井秀一通过留下来的手机获得了楠田陆道的指纹，并且将楠田陆道的尸体收了起来。
他和柯南的思维能够合上，寥寥数语就交流了想法，一起完善了柯南的方案。
柯南原本打算做更复杂的计划，但赤井秀一认为没有那个必要。
“组织很快就会行动了。”赤井秀一说，“你上次说，你认识的人告诉你，新加入了救人的组织成员，但只有一个人。如果只有一个人，那么行动计划还是以之前的行动小组为主。以琴酒的风格，他根本不会多等。”
“而且，公安的人也不会坐以待毙。”