在得知大蛇丸叛晓之后，周尊表示老子也不干了，任务太麻烦，不想出门，我只想静静做我的研究型宅男，所以周尊表示自己还是做回反骨仔算了。反正晓组织反骨仔也算是传统了，前有宇智波鼬，后有蝎放水送人头，后期更是阿飞和黑白绝这两个大反骨仔，最让人无语的是是晓组织名义上的头领长门竟然在鸣人的嘴炮下，自己背叛组织，复活敌人。
你以为你是黑衣组织酒厂么？TM连BOSS也当反骨仔，所以，对于晓组织，周尊根本就没把它当成一个正经的恐怖组织看，更多是觉得是一群中二病搞出来的搞笑组织。
当时鬼鲛和那名宇智波一族的忍者，直接就想解决周尊，可惜这里可不是晓组织，而周尊也不是独行侠，根本没有出手，只是让辉夜君麻吕和漩涡香磷等人出手，直接挡住了鬼鲛和那名宇智波忍者。鬼鲛的鲛肌完全被辉夜君麻吕的剑术和魔种力量克制，而漩涡香磷在受到周尊的实验进行血脉开发之后，血脉返祖，体内的查克拉不仅多出了强大的生命力，而且对封印术的增福更大了。金刚封锁产生的查克拉锁链不仅仅尾兽，其他忍者的查克拉也能被封印上。
光是这两人，就让鬼鲛和那宇智波一族的忍者头疼万分，被克制的非常厉害，使得他们两个影级的忍者，竟然被两个上忍给压制的没什么脾气，不仅如此，周尊实验室本身就在铁之国的京都，武士和阴阳师也纷纷赶来。
最后那名宇智波忍者竟然展现了万花筒写轮眼，开启了须佐能乎，借助须佐构造出查克拉的翅膀，靠着飞行能力才及时逃走。但这也让周尊发现，那个宇智波忍者并非是宇智波鼬，因为对方的须佐竟然是绿色的，倒是让周尊想到了一个人，宇智波止水
连忙让人寻找忍界发生的各种大事，这才发现木叶中出了一个叛徒，正是宇智波止水，在宇智波一族大肆杀戮，将木叶第一豪门的高层和精锐战力几乎屠杀了大半，剩下的只有一些老幼病残和没能开眼的忍者，真正开眼的宇智波忍者，只留下极为少数的部分弱小忍者还存在。
整个木叶最强忍族，从以前足以与木叶分庭抗礼的族群，硬生生变成了要靠木叶保护的弱小族群。甚至连一般的忍族也不如的地步。而能以一己之力击溃一个忍族，并且逃过木叶追杀的宇智波止水名号可以说瞬间响彻了整个忍界。
而宇智波一族族长虽然逃脱了一劫，不过也重伤不起，不仅双目被挖，而且被破坏了全身的经脉神经，能活下来就不错了，以后根本无法做忍者了。
这个消息，倒是让周尊惊讶了，尝试联络了在宇智波鼬和木叶的“伪神格”分体，知晓了这些原来是宇智波鼬的策略，宇智波鼬直接屠杀了近乎大半的宇智波一族，将其中的鹰派和部分偏激的忍者全部杀了干净，嫁祸给了宇智波止水，逼迫宇智波止水按照他的计划叛逃木叶，加入晓组织卧底。
知晓原因之后，周尊不得不想自己是不是给宇智波鼬的私货太多了，搞得现在怎么这么腹黑，连自己亦师亦友的同族也坑的如此不留情。
不过宇智波鼬的计划，的确取得了巨大的成功，宇智波一族并非全部都是战争狂或者权利疯子，大部分底层的普通族人，甚至大部分没开眼的族人，其实还是非常满意这样的生活。也只有部分在战场上立功却因为原因没得到待遇，或是在战场上亲友死亡走向偏激，亦或是最后部分受到家族教育的精锐，才会想着没事和木叶对着干。
这部分人死的差不多，剩下的人根本不想要和木叶搞什么斗争，于是宇智波与木叶的矛盾很多都偃旗息鼓。而木叶也乐见于此，宇智波损失大半的鹰派和精锐，短期内的确削弱了木叶的兵力，可是宇智波一族到底还是没有灭族，只要一代人培养起来，没了激进派，宇智波一族将会彻底融入木叶，木叶可谓得大于失。