东汉时，以三公平分丞相的权力。太尉为三公之首，掌管军政。属官有长史、东曹、西曹、户曹、奏曹、辞曹、法曹、尉曹、贼曹、决曹、兵曹、金曹、仓曹、主簿。
司徒
三公之一，掌管民政，与后来丞相的职权范围相近。曹丕称帝后，曾改魏国的相国为司徒。属官有长史、东曹、西曹、户曹、奏曹、辞曹、法曹、尉曹、贼曹、决曹、兵曹、金曹、仓曹、主簿。
司空
三公之一，掌管水土之事，位为三公之末，与后来工部尚书的权利相近。后世也常以“司空”为工部尚书的代名词。属官有长史、东曹、西曹、户曹、奏曹、辞曹、法曹、尉曹、贼曹、决曹、兵曹、金曹、仓曹、主簿。
御史大夫
原三公之一，掌监察、执法，后改以司空为三公，御史大夫省。魏国建立时，以华歆为御史大夫，复有此官职。
大司马
此官职为汉武帝初建，因将军位同九卿，故设大司马官职与三公同列，以示对武官的尊宠。东汉刚刚建立的时候，刘秀以大司马为三公之一，后改为太尉。西汉末年别置大司马一职，位在三公之上，魏晋时沿袭。
九卿
太常、光禄勋、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府为九卿，位在三公之后，为中央各行政机关的总称。三国以后，九卿职权渐轻，并逐步为六部所替代。
太常奉常
九卿之一，掌礼仪祭祀。下属官职有太史令、博士祭酒、太祝令、太宰令、大乐令等。
光禄勋郎中令
九卿之一，宿卫侍从之官。下属官职有五官中郎将、左中郎将、右中郎将、虎贲中郎将、羽林中郎将、奉车都尉、驸马都尉、骑都尉、光禄大夫、太中大夫、中散大夫、谏议大夫、议郎、谒者仆射等。
卫尉
九卿之一，掌宫门禁卫。
太仆
九卿之一，掌车马。下属官员有考工令、车府令、未央厩令等。
廷尉大理
九卿之一，掌诉讼断案，平决诏狱。类似于后来的刑部尚书。
大鸿胪典客
九卿之一，掌管诸侯和各少数民族事务，相当于外交官员。
宗正
九卿之一，管理皇族事务，一般由皇族中德高望重之人担任。
大司农治粟内史
九卿之一，掌管一国之租税钱谷盐铁和国家财政收支，职权与后来的户部尚书相近，后世也以“司农”为户部尚书的别称。下属官员有太仓令、平准令、导官令等。
少腐；
九卿之一，掌管宫中御用之物。下属官员有太医令、太官令、守宫令、侍中、中常侍宦官、黄门侍郎、小黄门宦官、尚书令、尚书仆射、尚书、御史中丞、兰台令史等。
执金吾中尉
位同九卿，负责宫外戒司，京师治安，防止出现水火之事。下属官员有武库令。
太子太傅
位同九卿，辅导太子。
大长秋
长秋宫是汉朝皇后居住之所在。所以大长秋其实是皇后所用的官属的负责人，一般由宦官担任。曹操的祖父曹腾即为“中常侍大长秋”。有些三国游戏将大长秋作为普通官职，是不适合的。
中常侍
高级太监，汉朝末年掀起腥风血雨的“十常侍”即此官职。
小黄门
中级太监。
中黄门
低级太监。
侍中
内朝官之一，位略低于九卿，秩“比二千石”。常由博学高德之士担任，切问近对，是皇帝在管理国家时的顾问。在魏晋时期，为门下省的长官，为事实上的宰相。
尚书令