崇祯朝，他双亲去世，守制期满，正好碰上东林被再次清洗，浙党、齐党重张大权，很快，他便起复为顺天府丞，进而擢升为光禄正卿，客观来说，他资历是足够出任六部尚书了，但是职位却不够，如果按正常升迁流程，他想爬上六部尚书的高位，起码还要熬六年。
但是，有昔日的阉党兄弟浙党提携，这六年就不用等了，工部尚书的位置早已给他预定，只是温体仁一直没有找到干翻毕懋良的借口，贸贸然把他提上来与毕懋良角逐，温体仁很怕崇祯会选择能力、资历和职位都比张至发要强的毕懋良，所以，工部尚书这个位置一直空着。
这下机会终于来了，崇祯已经首肯，要清洗张斌党羽，温体仁立马借机将毕懋良牵连进去，毕懋康这会儿是福建承宣布政使司左布政使，妥妥的张斌党羽，作为他的亲大哥，毕懋良难道不是张斌的党羽吗？
就算他不是也得是啊！
他一通谗言说出来，崇祯终于点头，撸了！
于是乎，毕懋良很快就接都了这份勒令其告老还乡的京察通报。
温体仁不知道，他歪打正着，毕懋良还真是张斌一党。
毕懋良接到京察通报顿时心灰意冷，他没跟任何人说，径直辞官而去，因为这年老的评定一般都要经过皇上点头才能写上去，既然写在通告上就证明，是皇上认为自己年老昏聩，不能任仕，那还有什么好申辩的，说再多也是自取其辱而已。
毕懋良致仕只是开始，第二天，远在大名府的卢象升也收到了京察通报，评定其守平、政长、才平、年平，拟降职留用，免其总督宣大、山西军务之职，降为大名巡抚，只负责大名、广平、顺德三府军务。
这还是崇祯看卢象升在怀庆府大破反贼，战功赫赫，不忍直接把他撸了，要不然，他也会被无情的清洗掉。
卢象升收到京察通报简直不敢相信自己的眼睛，他舍生忘死，好不容易击溃了二十多万反贼主力，不升职就算了，竟然还降职！
他这还算是轻的了，第三天，远在陕西的孙传庭便收到八百里加急传送的京察通报，评定其守平、政短、才平、年平，拟免除其三边总督之职，让他立刻回京城自辨！
孙传庭这个愤懑啊，他才刚把秦军操练的有模有样，就被罢免了，说他政绩差，总要他有机会率军去获取政绩啊！
这还不是最重要的，最重要的是，他这一走，五万秦军吃什么，虽说他已经在张斌的协助下在无定河和黄河沿岸开荒种地，收获了一季蕃薯和马铃薯，但那也只够五万大军吃一个来月的啊，他还准备在明年继续开荒种地，扩大蕃薯和马铃薯的产量呢，这下全完了，如果没有东盛堂的粮草支援，五万秦军甚至连这个年都过不去，因为到了十二月，他们就没东西吃了啊！
他知道，这是有人在背地里弄他和张斌呢，这一回京城，不罢职削籍就算不错了，想再回来当三边总督基本上是不可能的了，五万秦军啊，还未出动一兵一卒，就这么毁了，他真想不明白是为什么。
崇祯其实不为什么，就因为他是从福广出来的官员，为削弱张斌的势力，他这个总督，必须撤掉，他手下可有五万大军，一旦张斌图谋不轨，他就是天大的威胁，崇祯怎么可能让他继续在三边总督的位置上待下去。